I. Pastorale Grunddienste und Sakramentenpastoral
Leitung: Angelika Maucher
- Pastorale Querschnittsfragen und -projekte
- Gemeindekatechese
- Ehrenamtsarbeit und -fortbildung
- Diözesanrat der Katholiken und Laiengremien
- City-Seelsorge
– Augsburg
– Kempten
– Memmingen - Pastoral im ländlichen Raum
- Medienpastoral und -pädagogik
– AV-Medienzentrale
– Kirchl. Büchereiwesen (St. Michaelsbund) - Kirche und Umwelt: Umweltbeauftragte der Diözese Augsburg
- Pilgerstelle/Wallfahrerverein
- Außenstellen des Bischöflichen Seelsorgeamtes
II. Seelsorge in den Generationen
Leitung: Christian Öxler
Stellvertreter: Diakon Robert Ischwang
- Pastoral in Kindertageseinrichtungen
- Ehe- und Familienseelsorge mit natürliche Familienplanung und MFM
- Frauenseelsorge und Alleinerziehendenseelsorge
- Männerseelsorge
- Altenseelsorge und Altenheimseelsorge
- Hochschul- und Akademikerseelsorge
III. Seelsorge in besonderen Lebenslagen
Leitung: Angelika Maucher
Stellvertreter: Diakon Thomas Schmidt
- Psychologische Beratungsstellen für Ehe-, Familien- und Lebensfragen
- Behindertenseelsorge
- Notfallseelsorge
- Gefängnisseelsorge
- Polizeiseelsorge
- Seelsorge für Migranten (Heimatvertriebene und [Spät-] Aussiedler, Flüchtlinge, u.a.)
- Tourismus- und Kurseelsorge
- Telefonseelsorge
- Betriebsseelsorge
- Seelsorge in Feuerwehr und Rettungsdienst der Diözese Augsburg
IV. Kranken- und Krankenhausseelsorge
Leitung: Pfarrer Michael Saurler
- Seelsorge in Krankenhäusern
- Seelsorge in Hospizen und palliativen Versorgungen
- Bildungs- und Begegnungsstätte Haus Tobias
- Seelsorge für HIV-positive Menschen
- Trauerbegleitung
- Arbeitsgemeinschaft Krankenhilfe
V. Verbände und Initiativen von Gläubigen
Leitung: Domdekan Msgr. Dr. Wolfgang Hacker
VI. Weltkirche
Leitung: Anton Stegmair
Der Hauptabteilung zugeordnet sind die Kirchlichen Bildungs- und Tagungshäuser.
Koordinator: Robert Mayer
Die Hauptabteilung Seelsorge kooperiert eng mit dem Institut für Neuevangelisierung.